Protein–RNA interactions for Protein: Q8K297

Colgalt1, Procollagen galactosyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt1Q8K297 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Colgalt1Q8K297 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Colgalt1Q8K297 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Colgalt1Q8K297 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Colgalt1Q8K297 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Colgalt1Q8K297 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Colgalt1Q8K297 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Colgalt1Q8K297 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Colgalt1Q8K297 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Colgalt1Q8K297 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Colgalt1Q8K297 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Colgalt1Q8K297 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Colgalt1Q8K297 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Colgalt1Q8K297 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Colgalt1Q8K297 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Colgalt1Q8K297 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Colgalt1Q8K297 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Colgalt1Q8K297 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Colgalt1Q8K297 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Colgalt1Q8K297 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Colgalt1Q8K297 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Colgalt1Q8K297 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Colgalt1Q8K297 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Colgalt1Q8K297 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Colgalt1Q8K297 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Colgalt1Q8K297 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Colgalt1Q8K297 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Colgalt1Q8K297 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Colgalt1Q8K297 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Colgalt1Q8K297 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Colgalt1Q8K297 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Colgalt1Q8K297 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Colgalt1Q8K297 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Colgalt1Q8K297 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Colgalt1Q8K297 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Colgalt1Q8K297 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Colgalt1Q8K297 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Colgalt1Q8K297 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Colgalt1Q8K297 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Colgalt1Q8K297 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Colgalt1Q8K297 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Colgalt1Q8K297 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Colgalt1Q8K297 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms