Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mtmr3Q8K296 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms