Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim68Q8K243 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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