Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms