Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FgbQ8K0E8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms