Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZX4

Rbm17, Splicing factor 45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm17Q8JZX4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbm17Q8JZX4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbm17Q8JZX4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbm17Q8JZX4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbm17Q8JZX4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbm17Q8JZX4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbm17Q8JZX4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbm17Q8JZX4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbm17Q8JZX4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbm17Q8JZX4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbm17Q8JZX4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbm17Q8JZX4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbm17Q8JZX4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbm17Q8JZX4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbm17Q8JZX4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbm17Q8JZX4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbm17Q8JZX4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbm17Q8JZX4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbm17Q8JZX4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbm17Q8JZX4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rbm17Q8JZX4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms