Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Afg3l2Q8JZQ2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Afg3l2Q8JZQ2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Afg3l2Q8JZQ2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Afg3l2Q8JZQ2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Afg3l2Q8JZQ2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Afg3l2Q8JZQ2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Afg3l2Q8JZQ2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Afg3l2Q8JZQ2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Afg3l2Q8JZQ2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Afg3l2Q8JZQ2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Afg3l2Q8JZQ2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Afg3l2Q8JZQ2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Afg3l2Q8JZQ2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Afg3l2Q8JZQ2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Afg3l2Q8JZQ2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Afg3l2Q8JZQ2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Afg3l2Q8JZQ2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Afg3l2Q8JZQ2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Afg3l2Q8JZQ2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Afg3l2Q8JZQ2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Afg3l2Q8JZQ2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Afg3l2Q8JZQ2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Afg3l2Q8JZQ2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Afg3l2Q8JZQ2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Afg3l2Q8JZQ2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Afg3l2Q8JZQ2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Afg3l2Q8JZQ2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Afg3l2Q8JZQ2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Afg3l2Q8JZQ2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Afg3l2Q8JZQ2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Afg3l2Q8JZQ2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Afg3l2Q8JZQ2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Afg3l2Q8JZQ2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Afg3l2Q8JZQ2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Afg3l2Q8JZQ2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Afg3l2Q8JZQ2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Afg3l2Q8JZQ2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Afg3l2Q8JZQ2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Afg3l2Q8JZQ2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Afg3l2Q8JZQ2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Afg3l2Q8JZQ2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Afg3l2Q8JZQ2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Afg3l2Q8JZQ2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Afg3l2Q8JZQ2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Afg3l2Q8JZQ2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Afg3l2Q8JZQ2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Afg3l2Q8JZQ2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Afg3l2Q8JZQ2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Afg3l2Q8JZQ2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Afg3l2Q8JZQ2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Afg3l2Q8JZQ2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Afg3l2Q8JZQ2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Afg3l2Q8JZQ2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Afg3l2Q8JZQ2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Afg3l2Q8JZQ2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Afg3l2Q8JZQ2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Afg3l2Q8JZQ2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Afg3l2Q8JZQ2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms