Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJF9

Ago3, Protein argonaute-3, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ago3Q8CJF9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ago3Q8CJF9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ago3Q8CJF9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ago3Q8CJF9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ago3Q8CJF9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ago3Q8CJF9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ago3Q8CJF9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ago3Q8CJF9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms