Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIL4

Uncharacterized protein C1orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CIL4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q8CIL4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q8CIL4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q8CIL4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Q8CIL4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q8CIL4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q8CIL4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q8CIL4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q8CIL4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q8CIL4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q8CIL4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q8CIL4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q8CIL4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8CIL4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8CIL4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8CIL4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8CIL4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8CIL4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8CIL4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8CIL4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q8CIL4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q8CIL4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q8CIL4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8CIL4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8CIL4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8CIL4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8CIL4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8CIL4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8CIL4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8CIL4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8CIL4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8CIL4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q8CIL4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q8CIL4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q8CIL4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q8CIL4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q8CIL4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q8CIL4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q8CIL4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q8CIL4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q8CIL4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q8CIL4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q8CIL4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q8CIL4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q8CIL4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q8CIL4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q8CIL4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q8CIL4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms