Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gpc3Q8CFZ4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpc3Q8CFZ4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpc3Q8CFZ4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpc3Q8CFZ4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpc3Q8CFZ4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpc3Q8CFZ4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpc3Q8CFZ4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpc3Q8CFZ4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpc3Q8CFZ4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpc3Q8CFZ4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpc3Q8CFZ4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpc3Q8CFZ4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc3Q8CFZ4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc3Q8CFZ4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc3Q8CFZ4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc3Q8CFZ4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc3Q8CFZ4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc3Q8CFZ4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc3Q8CFZ4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc3Q8CFZ4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc3Q8CFZ4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc3Q8CFZ4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpc3Q8CFZ4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpc3Q8CFZ4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpc3Q8CFZ4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpc3Q8CFZ4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpc3Q8CFZ4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpc3Q8CFZ4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpc3Q8CFZ4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpc3Q8CFZ4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpc3Q8CFZ4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpc3Q8CFZ4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpc3Q8CFZ4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpc3Q8CFZ4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpc3Q8CFZ4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms