Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFW7

Cc2d2a, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2aQ8CFW7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Cc2d2aQ8CFW7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Cc2d2aQ8CFW7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Cc2d2aQ8CFW7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Cc2d2aQ8CFW7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Cc2d2aQ8CFW7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Cc2d2aQ8CFW7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Cc2d2aQ8CFW7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Cc2d2aQ8CFW7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Cc2d2aQ8CFW7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Cc2d2aQ8CFW7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Cc2d2aQ8CFW7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Cc2d2aQ8CFW7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Cc2d2aQ8CFW7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Cc2d2aQ8CFW7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Cc2d2aQ8CFW7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Cc2d2aQ8CFW7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Cc2d2aQ8CFW7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Cc2d2aQ8CFW7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Cc2d2aQ8CFW7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Cc2d2aQ8CFW7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Cc2d2aQ8CFW7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Cc2d2aQ8CFW7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Cc2d2aQ8CFW7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Cc2d2aQ8CFW7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Cc2d2aQ8CFW7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Cc2d2aQ8CFW7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
Cc2d2aQ8CFW7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Cc2d2aQ8CFW7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
Cc2d2aQ8CFW7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Cc2d2aQ8CFW7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Cc2d2aQ8CFW7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Cc2d2aQ8CFW7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Cc2d2aQ8CFW7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Cc2d2aQ8CFW7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Cc2d2aQ8CFW7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Cc2d2aQ8CFW7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Cc2d2aQ8CFW7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Cc2d2aQ8CFW7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Cc2d2aQ8CFW7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Cc2d2aQ8CFW7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
Cc2d2aQ8CFW7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Cc2d2aQ8CFW7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Cc2d2aQ8CFW7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Cc2d2aQ8CFW7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Cc2d2aQ8CFW7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Cc2d2aQ8CFW7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Cc2d2aQ8CFW7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Cc2d2aQ8CFW7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Cc2d2aQ8CFW7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Cc2d2aQ8CFW7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Cc2d2aQ8CFW7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Cc2d2aQ8CFW7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Cc2d2aQ8CFW7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Cc2d2aQ8CFW7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Cc2d2aQ8CFW7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Cc2d2aQ8CFW7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Cc2d2aQ8CFW7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Cc2d2aQ8CFW7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Cc2d2aQ8CFW7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Cc2d2aQ8CFW7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Cc2d2aQ8CFW7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Cc2d2aQ8CFW7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Cc2d2aQ8CFW7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms