Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc8Q8CFD5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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