Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc28aQ8CEI3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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