Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nrip1Q8CBD1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nrip1Q8CBD1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nrip1Q8CBD1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nrip1Q8CBD1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nrip1Q8CBD1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nrip1Q8CBD1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nrip1Q8CBD1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nrip1Q8CBD1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nrip1Q8CBD1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nrip1Q8CBD1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nrip1Q8CBD1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nrip1Q8CBD1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nrip1Q8CBD1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nrip1Q8CBD1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nrip1Q8CBD1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nrip1Q8CBD1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nrip1Q8CBD1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nrip1Q8CBD1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nrip1Q8CBD1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nrip1Q8CBD1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nrip1Q8CBD1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nrip1Q8CBD1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nrip1Q8CBD1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrip1Q8CBD1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms