Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Slfn5Q8CBA2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms