Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAL5

Gpc5, Glypican-5, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc5Q8CAL5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Gpc5Q8CAL5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms