Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAE9

Podxl2, Podocalyxin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podxl2Q8CAE9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Podxl2Q8CAE9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms