Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc15Q8C9M2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms