Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoa5Q8C7G5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoa5Q8C7G5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoa5Q8C7G5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoa5Q8C7G5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoa5Q8C7G5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoa5Q8C7G5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoa5Q8C7G5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoa5Q8C7G5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoa5Q8C7G5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoa5Q8C7G5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoa5Q8C7G5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoa5Q8C7G5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoa5Q8C7G5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoa5Q8C7G5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoa5Q8C7G5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoa5Q8C7G5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoa5Q8C7G5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoa5Q8C7G5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Apoa5Q8C7G5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Apoa5Q8C7G5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apoa5Q8C7G5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apoa5Q8C7G5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apoa5Q8C7G5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoa5Q8C7G5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoa5Q8C7G5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoa5Q8C7G5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoa5Q8C7G5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoa5Q8C7G5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoa5Q8C7G5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoa5Q8C7G5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms