Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C708 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C708 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C708 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C708 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C708 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C708 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C708 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C708 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C708 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C708 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C708 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C708 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C708 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C708 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C708 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C708 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C708 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C708 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C708 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C708 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C708 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C708 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C708 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C708 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C708 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C708 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C708 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C708 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C708 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C708 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C708 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C708 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C708 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C708 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C708 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C708 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C708 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8C708 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8C708 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8C708 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8C708 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8C708 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8C708 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8C708 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C708 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C708 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C708 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C708 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C708 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C708 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C708 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C708 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C708 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C708 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C708 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C708 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C708 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C708 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C708 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C708 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C708 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C708 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C708 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C708 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C708 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C708 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C708 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q8C708 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C708 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C708 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C708 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C708 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C708 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C708 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C708 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C708 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C708 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C708 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C708 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C708 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C708 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C708 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C708 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C708 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C708 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C708 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C708 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C708 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C708 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C708 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C708 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C708 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C708 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C708 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C708 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C708 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C708 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C708 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C708 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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