Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp20Q8C6M1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms