Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms