Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccser1Q8C0C4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccser1Q8C0C4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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