Protein–RNA interactions for Protein: Q8C050

Rps6ka5, Ribosomal protein S6 kinase alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka5Q8C050 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rps6ka5Q8C050 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6ka5Q8C050 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6ka5Q8C050 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6ka5Q8C050 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6ka5Q8C050 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6ka5Q8C050 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6ka5Q8C050 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6ka5Q8C050 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6ka5Q8C050 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6ka5Q8C050 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps6ka5Q8C050 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps6ka5Q8C050 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps6ka5Q8C050 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps6ka5Q8C050 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps6ka5Q8C050 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps6ka5Q8C050 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps6ka5Q8C050 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps6ka5Q8C050 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps6ka5Q8C050 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps6ka5Q8C050 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps6ka5Q8C050 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps6ka5Q8C050 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps6ka5Q8C050 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps6ka5Q8C050 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps6ka5Q8C050 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps6ka5Q8C050 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps6ka5Q8C050 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps6ka5Q8C050 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps6ka5Q8C050 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps6ka5Q8C050 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6ka5Q8C050 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6ka5Q8C050 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6ka5Q8C050 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6ka5Q8C050 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6ka5Q8C050 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6ka5Q8C050 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms