Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Iffo1Q8BXL9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Iffo1Q8BXL9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Iffo1Q8BXL9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Iffo1Q8BXL9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Iffo1Q8BXL9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Iffo1Q8BXL9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Iffo1Q8BXL9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Iffo1Q8BXL9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Iffo1Q8BXL9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Iffo1Q8BXL9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Iffo1Q8BXL9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Iffo1Q8BXL9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Iffo1Q8BXL9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Iffo1Q8BXL9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Iffo1Q8BXL9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Iffo1Q8BXL9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Iffo1Q8BXL9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Iffo1Q8BXL9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Iffo1Q8BXL9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Iffo1Q8BXL9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Iffo1Q8BXL9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Iffo1Q8BXL9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Iffo1Q8BXL9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Iffo1Q8BXL9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Iffo1Q8BXL9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Iffo1Q8BXL9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Iffo1Q8BXL9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Iffo1Q8BXL9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Iffo1Q8BXL9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Iffo1Q8BXL9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Iffo1Q8BXL9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Iffo1Q8BXL9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Iffo1Q8BXL9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Iffo1Q8BXL9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Iffo1Q8BXL9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Iffo1Q8BXL9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms