Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL7

Arfrp1, ADP-ribosylation factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfrp1Q8BXL7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfrp1Q8BXL7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfrp1Q8BXL7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfrp1Q8BXL7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfrp1Q8BXL7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfrp1Q8BXL7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfrp1Q8BXL7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfrp1Q8BXL7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfrp1Q8BXL7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfrp1Q8BXL7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfrp1Q8BXL7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfrp1Q8BXL7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfrp1Q8BXL7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfrp1Q8BXL7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfrp1Q8BXL7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfrp1Q8BXL7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfrp1Q8BXL7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfrp1Q8BXL7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfrp1Q8BXL7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfrp1Q8BXL7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfrp1Q8BXL7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfrp1Q8BXL7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arfrp1Q8BXL7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arfrp1Q8BXL7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arfrp1Q8BXL7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfrp1Q8BXL7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arfrp1Q8BXL7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arfrp1Q8BXL7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Arfrp1Q8BXL7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arfrp1Q8BXL7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Arfrp1Q8BXL7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arfrp1Q8BXL7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arfrp1Q8BXL7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arfrp1Q8BXL7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms