Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV84

Prr9, Proline-rich protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr9Q8BV84 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr9Q8BV84 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr9Q8BV84 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr9Q8BV84 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr9Q8BV84 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr9Q8BV84 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr9Q8BV84 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr9Q8BV84 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr9Q8BV84 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr9Q8BV84 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr9Q8BV84 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr9Q8BV84 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr9Q8BV84 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr9Q8BV84 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr9Q8BV84 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr9Q8BV84 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prr9Q8BV84 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr9Q8BV84 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr9Q8BV84 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr9Q8BV84 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr9Q8BV84 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr9Q8BV84 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr9Q8BV84 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr9Q8BV84 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr9Q8BV84 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr9Q8BV84 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr9Q8BV84 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr9Q8BV84 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr9Q8BV84 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr9Q8BV84 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr9Q8BV84 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prr9Q8BV84 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prr9Q8BV84 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prr9Q8BV84 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prr9Q8BV84 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prr9Q8BV84 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prr9Q8BV84 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prr9Q8BV84 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prr9Q8BV84 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prr9Q8BV84 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms