Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTY8

Scfd2, Sec1 family domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scfd2Q8BTY8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Scfd2Q8BTY8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scfd2Q8BTY8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms