Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRN9

Cc2d1b, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d1bQ8BRN9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cc2d1bQ8BRN9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cc2d1bQ8BRN9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cc2d1bQ8BRN9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cc2d1bQ8BRN9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cc2d1bQ8BRN9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cc2d1bQ8BRN9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cc2d1bQ8BRN9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cc2d1bQ8BRN9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cc2d1bQ8BRN9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cc2d1bQ8BRN9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cc2d1bQ8BRN9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms