Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR07

Bicd1, Protein bicaudal D homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bicd1Q8BR07 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bicd1Q8BR07 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms