Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMZ5

Tsen34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsen34Q8BMZ5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsen34Q8BMZ5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsen34Q8BMZ5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsen34Q8BMZ5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsen34Q8BMZ5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsen34Q8BMZ5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsen34Q8BMZ5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsen34Q8BMZ5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsen34Q8BMZ5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsen34Q8BMZ5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsen34Q8BMZ5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsen34Q8BMZ5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsen34Q8BMZ5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsen34Q8BMZ5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsen34Q8BMZ5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsen34Q8BMZ5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsen34Q8BMZ5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsen34Q8BMZ5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsen34Q8BMZ5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsen34Q8BMZ5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsen34Q8BMZ5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsen34Q8BMZ5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsen34Q8BMZ5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsen34Q8BMZ5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsen34Q8BMZ5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsen34Q8BMZ5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsen34Q8BMZ5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsen34Q8BMZ5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsen34Q8BMZ5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsen34Q8BMZ5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsen34Q8BMZ5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsen34Q8BMZ5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsen34Q8BMZ5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsen34Q8BMZ5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsen34Q8BMZ5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsen34Q8BMZ5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsen34Q8BMZ5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsen34Q8BMZ5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsen34Q8BMZ5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsen34Q8BMZ5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsen34Q8BMZ5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsen34Q8BMZ5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsen34Q8BMZ5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsen34Q8BMZ5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsen34Q8BMZ5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsen34Q8BMZ5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsen34Q8BMZ5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsen34Q8BMZ5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsen34Q8BMZ5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsen34Q8BMZ5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsen34Q8BMZ5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsen34Q8BMZ5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsen34Q8BMZ5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsen34Q8BMZ5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsen34Q8BMZ5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsen34Q8BMZ5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsen34Q8BMZ5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsen34Q8BMZ5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsen34Q8BMZ5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms