Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMJ8

Sp8, Transcription factor Sp8, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp8Q8BMJ8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sp8Q8BMJ8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sp8Q8BMJ8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sp8Q8BMJ8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sp8Q8BMJ8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Sp8Q8BMJ8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sp8Q8BMJ8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sp8Q8BMJ8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sp8Q8BMJ8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sp8Q8BMJ8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sp8Q8BMJ8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sp8Q8BMJ8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sp8Q8BMJ8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sp8Q8BMJ8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sp8Q8BMJ8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sp8Q8BMJ8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sp8Q8BMJ8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sp8Q8BMJ8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sp8Q8BMJ8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sp8Q8BMJ8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sp8Q8BMJ8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sp8Q8BMJ8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sp8Q8BMJ8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sp8Q8BMJ8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sp8Q8BMJ8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sp8Q8BMJ8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sp8Q8BMJ8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sp8Q8BMJ8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sp8Q8BMJ8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sp8Q8BMJ8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sp8Q8BMJ8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sp8Q8BMJ8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sp8Q8BMJ8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sp8Q8BMJ8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sp8Q8BMJ8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sp8Q8BMJ8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sp8Q8BMJ8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sp8Q8BMJ8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Sp8Q8BMJ8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sp8Q8BMJ8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sp8Q8BMJ8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sp8Q8BMJ8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Sp8Q8BMJ8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sp8Q8BMJ8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sp8Q8BMJ8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sp8Q8BMJ8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sp8Q8BMJ8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sp8Q8BMJ8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sp8Q8BMJ8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms