Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fbxo38Q8BMI0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fbxo38Q8BMI0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fbxo38Q8BMI0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fbxo38Q8BMI0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fbxo38Q8BMI0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fbxo38Q8BMI0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fbxo38Q8BMI0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fbxo38Q8BMI0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fbxo38Q8BMI0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms