Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG1

Atrip, ATR-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtripQ8BMG1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AtripQ8BMG1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms