Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gtf3c2Q8BL74 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c2Q8BL74 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c2Q8BL74 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c2Q8BL74 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c2Q8BL74 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c2Q8BL74 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c2Q8BL74 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c2Q8BL74 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c2Q8BL74 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c2Q8BL74 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c2Q8BL74 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c2Q8BL74 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c2Q8BL74 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c2Q8BL74 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c2Q8BL74 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c2Q8BL74 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c2Q8BL74 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c2Q8BL74 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c2Q8BL74 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c2Q8BL74 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c2Q8BL74 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c2Q8BL74 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c2Q8BL74 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c2Q8BL74 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c2Q8BL74 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c2Q8BL74 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c2Q8BL74 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms