Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Usp54Q8BL06 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Usp54Q8BL06 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Usp54Q8BL06 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Usp54Q8BL06 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms