Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zcchc4Q8BKW4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zcchc4Q8BKW4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms