Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpc2Q8BKV1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpc2Q8BKV1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpc2Q8BKV1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpc2Q8BKV1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpc2Q8BKV1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpc2Q8BKV1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpc2Q8BKV1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpc2Q8BKV1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpc2Q8BKV1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpc2Q8BKV1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpc2Q8BKV1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpc2Q8BKV1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpc2Q8BKV1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpc2Q8BKV1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpc2Q8BKV1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpc2Q8BKV1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpc2Q8BKV1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpc2Q8BKV1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpc2Q8BKV1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpc2Q8BKV1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpc2Q8BKV1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpc2Q8BKV1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpc2Q8BKV1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc2Q8BKV1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc2Q8BKV1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc2Q8BKV1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc2Q8BKV1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc2Q8BKV1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc2Q8BKV1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc2Q8BKV1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc2Q8BKV1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gpc2Q8BKV1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gpc2Q8BKV1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gpc2Q8BKV1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms