Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tnrc6bQ8BKI2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms