Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJN4

Fndc9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc9Q8BJN4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc9Q8BJN4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms