Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW1

Prune1, Exopolyphosphatase PRUNE1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune1Q8BIW1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prune1Q8BIW1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms