Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
D130040H23RikQ8BII3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms