Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH75

Rnf41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf41Q8BH75 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf41Q8BH75 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms