Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc38a9Q8BGD6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc38a9Q8BGD6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc38a9Q8BGD6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc38a9Q8BGD6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc38a9Q8BGD6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc38a9Q8BGD6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc38a9Q8BGD6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc38a9Q8BGD6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc38a9Q8BGD6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc38a9Q8BGD6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc38a9Q8BGD6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc38a9Q8BGD6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc38a9Q8BGD6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc38a9Q8BGD6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc38a9Q8BGD6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc38a9Q8BGD6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc38a9Q8BGD6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc38a9Q8BGD6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc38a9Q8BGD6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc38a9Q8BGD6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc38a9Q8BGD6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms