Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8BGC1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8BGC1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8BGC1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8BGC1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8BGC1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8BGC1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8BGC1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8BGC1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8BGC1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8BGC1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8BGC1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8BGC1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8BGC1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8BGC1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8BGC1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8BGC1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8BGC1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8BGC1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8BGC1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q8BGC1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q8BGC1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q8BGC1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8BGC1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Q8BGC1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8BGC1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q8BGC1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Q8BGC1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8BGC1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8BGC1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q8BGC1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8BGC1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8BGC1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q8BGC1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8BGC1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Q8BGC1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q8BGC1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8BGC1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Q8BGC1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8BGC1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8BGC1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8BGC1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8BGC1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8BGC1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8BGC1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8BGC1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q8BGC1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8BGC1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8BGC1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8BGC1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8BGC1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8BGC1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8BGC1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Q8BGC1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8BGC1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8BGC1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8BGC1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8BGC1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8BGC1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8BGC1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8BGC1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Q8BGC1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q8BGC1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8BGC1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q8BGC1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8BGC1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8BGC1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8BGC1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8BGC1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8BGC1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8BGC1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8BGC1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q8BGC1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q8BGC1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8BGC1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8BGC1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8BGC1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8BGC1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8BGC1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8BGC1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8BGC1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8BGC1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8BGC1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8BGC1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8BGC1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8BGC1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8BGC1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8BGC1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8BGC1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8BGC1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8BGC1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8BGC1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8BGC1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8BGC1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8BGC1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8BGC1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8BGC1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8BGC1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8BGC1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8BGC1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms