Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFW4

Trim65, Tripartite motif-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim65Q8BFW4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim65Q8BFW4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim65Q8BFW4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim65Q8BFW4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim65Q8BFW4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim65Q8BFW4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim65Q8BFW4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim65Q8BFW4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim65Q8BFW4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim65Q8BFW4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim65Q8BFW4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim65Q8BFW4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim65Q8BFW4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim65Q8BFW4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim65Q8BFW4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim65Q8BFW4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim65Q8BFW4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim65Q8BFW4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim65Q8BFW4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim65Q8BFW4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim65Q8BFW4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim65Q8BFW4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim65Q8BFW4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim65Q8BFW4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim65Q8BFW4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim65Q8BFW4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim65Q8BFW4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim65Q8BFW4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms