Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim19Q80ZU4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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