Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cracr2bQ80ZJ8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.9 ms