Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Kdm5bQ80Y84 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Kdm5bQ80Y84 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Kdm5bQ80Y84 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Kdm5bQ80Y84 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Kdm5bQ80Y84 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Kdm5bQ80Y84 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Kdm5bQ80Y84 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Kdm5bQ80Y84 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Kdm5bQ80Y84 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Kdm5bQ80Y84 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Kdm5bQ80Y84 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Kdm5bQ80Y84 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Kdm5bQ80Y84 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Kdm5bQ80Y84 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Kdm5bQ80Y84 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Kdm5bQ80Y84 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Kdm5bQ80Y84 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Kdm5bQ80Y84 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Kdm5bQ80Y84 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Kdm5bQ80Y84 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Kdm5bQ80Y84 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Kdm5bQ80Y84 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Kdm5bQ80Y84 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Kdm5bQ80Y84 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Kdm5bQ80Y84 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Kdm5bQ80Y84 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Kdm5bQ80Y84 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Kdm5bQ80Y84 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Kdm5bQ80Y84 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Kdm5bQ80Y84 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Kdm5bQ80Y84 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Kdm5bQ80Y84 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Kdm5bQ80Y84 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Kdm5bQ80Y84 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Kdm5bQ80Y84 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Kdm5bQ80Y84 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Kdm5bQ80Y84 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Kdm5bQ80Y84 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Kdm5bQ80Y84 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Kdm5bQ80Y84 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Kdm5bQ80Y84 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Kdm5bQ80Y84 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Kdm5bQ80Y84 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Kdm5bQ80Y84 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Kdm5bQ80Y84 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Kdm5bQ80Y84 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Kdm5bQ80Y84 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Kdm5bQ80Y84 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Kdm5bQ80Y84 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Kdm5bQ80Y84 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Kdm5bQ80Y84 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Kdm5bQ80Y84 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Kdm5bQ80Y84 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Kdm5bQ80Y84 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Kdm5bQ80Y84 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Kdm5bQ80Y84 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Kdm5bQ80Y84 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Kdm5bQ80Y84 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Kdm5bQ80Y84 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Kdm5bQ80Y84 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Kdm5bQ80Y84 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Kdm5bQ80Y84 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Kdm5bQ80Y84 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Kdm5bQ80Y84 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Kdm5bQ80Y84 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Kdm5bQ80Y84 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Kdm5bQ80Y84 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Kdm5bQ80Y84 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Kdm5bQ80Y84 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Kdm5bQ80Y84 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Kdm5bQ80Y84 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Kdm5bQ80Y84 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Kdm5bQ80Y84 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Kdm5bQ80Y84 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Kdm5bQ80Y84 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Kdm5bQ80Y84 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Kdm5bQ80Y84 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Kdm5bQ80Y84 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Kdm5bQ80Y84 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Kdm5bQ80Y84 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Kdm5bQ80Y84 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Kdm5bQ80Y84 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Kdm5bQ80Y84 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Kdm5bQ80Y84 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Kdm5bQ80Y84 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Kdm5bQ80Y84 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Kdm5bQ80Y84 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Kdm5bQ80Y84 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Kdm5bQ80Y84 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Kdm5bQ80Y84 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Kdm5bQ80Y84 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Kdm5bQ80Y84 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Kdm5bQ80Y84 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Kdm5bQ80Y84 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Kdm5bQ80Y84 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Kdm5bQ80Y84 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Kdm5bQ80Y84 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Kdm5bQ80Y84 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Kdm5bQ80Y84 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms