Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lrrc1Q80VQ1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrrc1Q80VQ1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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